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Agnès Michelot est enseignante-chercheure au sein de l’UMR CNRS 7266 LIENSs de La Rochelle Université. Elle est aussi Directrice de la Fédération de recherche CNRS en environnement et développement durable (FR CNRS 3097), vice-présidente et présidente d’honneur de la Société Française pour le Droit de l’Environnement (SFDE), membre du Steering Committee de la Commission mondiale du droit de l'environnement de l'UICN, membre du conseil scientifique de l’Office Français de la Biodiversité (OFB), personnalité régionale qualifiée du comité consultatif pour la Recherche, le Développement et l’Innovation durables en Nouvelle-Aquitaine et membre du Conseil scientifique du Réseau régional de Nouvelle Aquitaine sur la biodiversité (BIOSENA).
Elle a été personnalité associée du Conseil économique, social, environnemental (CESE France) et associée spéciale auprès de l’Institut des Nations Unies pour la Formation et la Recherche (UNITAR, Genève) pour le Programme de droit international de l’environnement.
Responsable de missions d’expertise juridique pour les Programmes du Fonds Européen pour le Développement de la Commission Européenne (protection des écosystèmes), elle a également été expert juriste auprès de l’UNESCO pour le programme l’Homme et la Biosphère (MAB) Division des Sciences Ecologiques pour le réseau AfriMAB.